Caracterización molecular de Guadua spp. Procedentes de la Selva Central del Perú, utilizando Marcadores ISSR

Autora: Lilia Rosario, Quispe López
liliarosarioql@gmail.com

Universidad Nacional Agraria La Molina
Tesis para optar el título de Ingeniero Forestal
Lima-Perú
2017



Figura1. A: Cámara electroforética horizontal. B: Imagen del ADN en el gel de agarosa, se observa que existe calidad suficiente para realizar el PCR.


RESUMEN

    Este estudio se realizó con los objetivos de caracterizar molecularmente especímenes de bambú provenientes de siete lugares de la selva central del Perú debido al problema en la identificación entre dos especies: Guadua weberbaueri y Guadua sarcocarpa, y evaluar la variabilidad genética inter e intra genotípica a través de marcadores moleculares ISSR, para contribuir al conocimiento de las características genómicas de las plantas leñosas del Perú.

    Se utilizaron marcadores moleculares ISSR para evaluar la diversidad genética de siete poblaciones naturales en la selva central del Perú. 96 ejemplares (hojas) de diferentes agrupaciones de culmos de G. weberbaueri y G. sarcocarpa fueron colectados; posteriormente se encontró que estos 96 ejemplares, correspondían a 75 individuos (21 fueron duplicados de otros). De seis primers seleccionados, se generaron 112 loci, de los cuales 95 fueron polimórficos (82,87%). El índice de Shannon en las poblaciones varió de 0,0431 (Satipo 2) a 0,2111 (Sepahua 1); 0,2647 en G. weberbaueri, 0,3876 en G. sarcocarpa y 0,5223 entre todos los individuos. La diversidad génica de Nei en las poblaciones varió de 0,0296 (Satipo 2) a 0,1366 (Sepahua 1); 0,1728 (G. weberbaueri), 0,2278 (G. sarcocarpa) y 0,3519 (todos los individuos). La diferenciación genética (GST) fue 0,8266 dentro de todos los individuos, 0,7586 dentro de G. weberbaueri y 0,4870 dentro de G. sarcocarpa, se expresa una alta diferenciación dentro de cada grupo. La diferenciación genética de Wright (FST) entre pares de poblaciones varió de 0,3563 (Cacazú vs Génova) a 0,9073 (Génova vs Sepahua 2), valores suficientes para definir grupos distintos. 

    Existe diferencia significativa de la variación genética entre especies (p-valor = 0,0479), diferencia altamente significativa de la variación genética entre poblaciones dentro de especies (p-valor = 0,0000) y de la variación genética entre todas las poblaciones (p-valor = 0,0000). La contribución en porcentaje de cada componente de variación genética fue 54,04 entre especies, 28,68 entre poblaciones dentro de especies y 17,29 entre todas las poblaciones. Se identificaron 2 clados de especímenes de bambú, congruentes con los análisis UPGMA-Jaccard, PCoA, nmMDS y dendograma sin raíz, corresponden a especies diferentes y están de acuerdo a su clasificación taxonómica natural. Clado (1) Guadua weberbaueri, con cuatro subclados (1.1) formado por 8 individuos de Bella Vista; (1.2) formado por 8 individuos de Satipo 2; (1.3) formado por 4 individuos de Cacazú y 4 de Génova y (1.4) formado por 10 individuos de Satipo 1. Clado (2) Guadua sarcocarpa, con dos subclados (2.1) formado por 31 individuos de Sepahua 1 y (2.2) formado por 10 individuos de Sepahua 2.


Palabras clave

caracterización molecular, Guadua weberbaueri, Guadua sarcocarpa, marcadores moleculares ISSR, variación genética, bambú


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